e-Riigi Akadeemia kuulub Arenduskoostöö Ümarlauda ja on Eesti Mittetulundusühingute ja Sihtasutuste Liidu liige.
e-Riigi Akadeemia tervitab ja tänab häid partnereid:
Avatud Eesti Fond, Majandus- ja Kommunikatsiooniministeerium, Andmekaitse Inspektsioon, Välisministeerium, Siseministeerium, Riigikantselei, Vabariigi Valimiskomisjon, Riigikontroll, Riigikogu, Vabaühenduste Fond, Kodanikuühiskonna Sihtkapital, Eesti IKT Demokeskus.